公司变更法定代表人的，变更登记申请书由变更后的法定代表人签署。这一结论的直接依据是《中华人民共和国公司法》第三十五条第三款。该条同时规定，公司申请变更登记，应当向公司登记机关提交公司法定代表人签署的变更登记申请书、依法作出的变更决议或者决定等文件；公司变更登记事项涉及修改公司章程的，应当提交修改后的公司章程。
《中华人民共和国公司法》第三十五条原文为：“公司申请变更登记，应当向公司登记机关提交公司法定代表人签署的变更登记申请书、依法作出的变更决议或者决定等文件。公司变更登记事项涉及修改公司章程的，应当提交修改后的公司章程。公司变更法定代表人的，变更登记申请书由变更后的法定代表人签署。”
建议在办理变更登记前，核对变更登记申请书签署人与变更后法定代表人是否一致，并核对所提交的变更决议或者决定、修改后的公司章程等文件是否齐备。
出处：《中华人民共和国公司法》第三十五条，2023年12月29日第二次修订，2024年7月1日施行。制定机关：全国人民代表大会常务委员会。官方全文链接：https://www.beijing.gov.cn/zhengce/zhengcefagui/qtwj/202306/t20230625_3144905.html
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